Автор Тема: Генетични изследваня на Каракачански кучета, под селекционен контрол на НОКК  (Прочетена 5158 пъти)

vano

  • Administrator
  • Hero Member
  • *****
  • Публикации: 1404
Както вече се спомена в други теми, преди няколко месеца разбрахме, че в БАН се правят митохондриални ДНК изследвания, на местни породи животни. НОКК също се включи в тези изследвания, като дадохме проби от автохтонната българска порода куче за охрана на стада - каракачанско куче.

Подбрани бяха 29 кучета, така, че да обхванем всички налични кучила, произведени от развъдчиците на организацията, както и кучета, от които нямаме кучила, но са в плановете за развъдна дейност на определени развъдчици. 

От всичките 161 произведени кучила в организацията сме обхванали 154, с които се работи.
В теста не са включени 7 кучилата:
Чавдар Горан x Емина То-По (от 06.05.2008, обхващащо Чавдар Горан) и Карабаш на Дойчин x Гери То-По (от 23.05.2008, обхващащо куче Карабаш), поради факта че нямаме живи  кучета от тези кучила, както и техни наследници.
А така също и 5-те кучила на развъдник Калин, в които фигурира кучка Нели, поради факта, че титуляра на развъдника(Захари), каза че на този етап не се интересува от подобни тестове.

vano

  • Administrator
  • Hero Member
  • *****
  • Публикации: 1404
Ето и кучетата, включени в изследването:
1. Панчо - НОКК 00815ПК
2. Шаро - НОКК 01159ПК
3. Шабан Мугленския - НОКК 00966Р
4. Бельо - НОКК 01236Р
5. Гуджо - НОКК 01019ПК
6. Йорго Мировяне - НОКК 00468ПК
7. Нане Мировяне - НОКК 00492ПК
8. Щам-Бубайко Мировяне - НОКК 00780ПК
9. Цезар Мировяне - НОКК 00743Р
10. Баян Мировяне - НОКК 00296ПК
11. Гриво Тито - НОКК 01082ПК
12. Анто Туран - НОКК 01282Р
13. Петър Мировяне - НОКК 01273ПК
14. Канджа Мировяне - НОКК01061Р
15. Янтра- НОКК 01135Р
16. Шара Вулкан - НОКК 01197ПК
17. Сура - НОКК 01190ПК
18. Бунтар Номад - НОКК 00886ПК
19. Кубрат То-По - НОКК 00389Р
20. Адра - НОКК 01131Р
21. Вирус Шопов
22. Вирна То-По - НОКК00342ПК
23. Атина Номад - НОКК00975ПК
24. Найда Мировяне - НОКК01232ПК
25. Рая - НОКК01224ПК
26. Сиси - НОКК00843Р
27. Кита - НОКК01101ПК
28. Цвета То-По - НОКК00570ПК
29. Шара на Росен Димитров

vano

  • Administrator
  • Hero Member
  • *****
  • Публикации: 1404
« Последна редакция: Април 05, 2022, 06:14:34 pm от vano »

vano

  • Administrator
  • Hero Member
  • *****
  • Публикации: 1404
« Последна редакция: Април 05, 2022, 06:15:05 pm от vano »

na Brad Pit- brat my

  • Гост
Може ли да разтълкува някой за тези мт ДНК?

na Brad Pit- brat my

  • Гост
Зададох въпроса общо и като за генен инженер  ;D  Адй де по- простичко. Такивали мт ДНК трябва да бъдат и какви не трябва да са? Какво обясниха учените от БАН ?

vano

  • Administrator
  • Hero Member
  • *****
  • Публикации: 1404
Учените от БАН, казаха че трябвада сме доволни от резултатите и ни поздравиха за кучетата, които отглеждаме. Казаха че са  кучета  с местен (автохтоннен) произход.

Ще се опитам да преразкажа с няколко думи, какво аз разбрах от разговорите с тях (не ги вземайте за 100% истина, щото не съм си водил записки, всичко е по спомен)

Анализа се прави на база  Митохондриалния генетичен маркер (D-loop, HVR1)
Това чудо аз не мога да го обясня, но в този маркер е определен контролен регион, който съдържа 721 контролни точки.
За този контролен регион има определен някакъв референтен ДНК профил, на  база ДНК-то от световната генетична банка.

За всяка проба на куче се извлича определено ДНК, нещо подобно:

BASE COUNT      204 a    200 c    117 g    211 t
ORIGIN   
        1 aaaaatggag agtaaccgcc ctccctaaga ctcaaggaag aagctcttgc tccaccatca
      61 gcacccaaag ctgagattct tcttaaacta ttccctgaca cccctacatt catatattga
      121 atcaccccta ctgtgctatg tcagtatctc caggtaaacc cttctcccct cccctatgta
      181 cgtcgtgcat taatggtttg ccccatgcat ataagcatgt acataatatt atatccttac
      241 ataggacata ttaactcaat ctcatagttc actgatctat caacagtaat cgaatgcata
      301 tcacttagtc caataagggc ttaatcacca tgcctcgaga aaccatcaac ccttgctcgt
      361 aatgtccctc ttctcgctcc gggcccatac taacgtgggg gttactatca tgaaactata
      421 cctggcatct ggttcttact tcagggccat aactttattt actccaatcc tactaattct
      481 cgcaaatggg acatctcgat ggactaatga ctaatcagcc catgatcaca cataactgtg
      541 gtgtcatgca tctggtatct tttaattttt agggggggaa tctgctatca ctcacctacg
      601 accgcaacgg cactaactct aacttatctt ctgctctcag ggaatatgcc cgtcgcggcc
      661 ctaatgcagt caaataactt gtagctggac ttattcatta tcatttatca actcacgcat
      721 aaaatcaagg tg

Специализиран софтуер извършва секвенционен анализ на  извлеченото ДНК на база н ареферентния ДНК профил и така се определя хаплогрупата на  съответното куче.

Хаплотиповете за кучетата  са 6 - A, B, C, D, E и F, като A е представен навсякъде по света, B и C навсякъде, без Америка, типът D е специфичен за Европа и Близкия изток, а E и F са ограничени в Източна Азия.

От там нататък всеки хаплотип съдържа подтип, подтипа свой подтип и т.н. се образува този мтДНК код (хаплогрупа).

И ако вземем за пример типа А, който се среща по целия свят, то вече подтипа А1 е характерен само за Европа, докато А2 за Азия и т.н.

Например, при изследването на бг автохтонните породи, за единия от БОК-овете излиза хаплогруп аА2а2а. При положение, че това куче трябва да има произход нашия регион (ограничен от контролния регион), то наличието на А2 типа, показва гени, харакртерни за кучета с произход Азия. При положение, че изследването обхваща 200 години назад, то тези азиатски гени са се влели в това наше куче в доста по-ново време, което говори за хибридизация с определена азиатска порода. И така. От тука нататък, ако собственика на това куче иска да разбере, дали е САО, кавказкао вчарка, тибетски дог, ще трябва да се направи сравнителен анализ с профили на съответните породи, което е доста по-скъпо.
« Последна редакция: Юли 19, 2018, 11:41:46 am от vano »

vano

  • Administrator
  • Hero Member
  • *****
  • Публикации: 1404
Другото нещо за което са много доволни учените от БАН, е че благодарение на пробите, които са взели от българските кучета са изолирали подтип на типа D, аименно D2b, който не е бил изолиран до сега никъде по света и се предполага, че си е уникален местен подхаплотип.

И което е още по-интересно, че този подтип е открит в няколко кучета, които нямат общи предци назад, поне до там, докъдето е известно, което говори че този тип не е изолиран случай при 1 куче, а се среща из различни кучета от региона.

na Brad Pit- brat my

  • Гост
Така вече е разбираемо. Благодаря.

vano

  • Administrator
  • Hero Member
  • *****
  • Публикации: 1404
И понеже виждам, че темата започва да  предизвикв аинтерес и в другите форуми, и вероятно ще възникнат много въпроси, а ние не сме компетентни по тази тематика, ще ви препоръчам да се обръщате към някои от авторите на въпросните изследвания: доц. д-р Георги Радославов или доц. д-р Петър Христов.

Мисля, че който искаможе да се свърже с тях, като се обърне към Института по биоразнообразие и екосистемни изследвания към Българска академия на науките.

Ето и една част от проектите, резултатите от които са публикувани в авторитетни научни издания, в които са  взели участие двамата автори:

доц. д-р Г. Радославов

доц. д-р П. Христов

Сами си преценете имат ли достатъчна квалификация, за да се доверим на това, което казват, а  то е че каракачанското куче е порода със старинен местен произход и трябва да сме изключително радостни и доволни че се е съхранило до наши дни.  Толкова от мен по въпроса.